Lidè nan Teknoloji molekil sèl
Malgre limit nan sansiblite, vitès ak gwosè a nan sekans ki ka jwenn, metòd la nouvo sekans ki dekri nan PNAS te woman ak te montre ase pwomès yo kenbe je a nan antrepriz kapitalis ki pwoche bò pwofesè a sou envesti nan teknoloji l 'yo. Gen dwe te yon bagay sou teknik la sa ki te sa envestisè antrepriz ap chèche pou jan sa a te yon premye , dapre yon anplwaye ki dire long tan an ak Senior Direktè Rechèch, Dr Timothy Harris ... envestisè antrepriz pa anjeneral apwòch syantis yo, li nan lòt fason alantou !
Piblikasyon PNAS te pibliye 1ye avril 2003, premye tou nan finansman pou yon nouvo konpayi te kòmanse 19 desanm 2003, epi sou 2 janvye 2004, Helicos te louvri pòt li yo avèk 5 anplwaye, ki gen ladan Dr. Harris, yon espesyalis sou syans mezi ak teknoloji molekil sèl. Helicos se kounye a sitiye nan Cambridge MA, USA, epi, apre 2 jij nan finansman envestisman, ak kòm nan yon IPO sou 27 me 2007, li se kounye a piblikman te fè kòmès anba NASDAQ: HLCS .
Helicos espesyalize nan teknoloji analiz jenetik, an patikilye, yon vrè selil sèl-molekil sekans (tSMS TM ) teknoloji, valide ak sekans nan genomic viris M13 jan sa dekri nan Magazin Syans nan mwa avril 2008. Espesyalize tSMS TM platfòm la itilize HeliScope TM Single la Sequencer molekil .
Dapre Dr Harris, pwojè patikilye sa a te kòmanse an janvye 2004, e pa jen 2005 yo te avèk siksè sekans viris M13 la, yon sekans medikal ki enpòtan, ki dekri nan papye Syans.
Kouman tSMS TM travay?
Yon strand ADN sou pè 100-200 baz koupe nan fragman ki pi piti lè l sèvi avèk anzim restriksyon , ak poly poly ke yo te ajoute. Sèkman ki pi kout yo Lè sa a, ibridize nan plak la selil Flux Helicos, ki gen dè milya de chenn polyt mare nan sifas li yo. Chak modil ibridize se sekans nan yon fwa. Se poutèt sa, dè milya pou chak kouri ka li. Etikèt la fèt nan "kad" ki fòme ak 4 sik chak, pou chak nan 4 baz nukleotid. Fluorescent-etikye baz yo te ajoute, ak yon lazè nan enstriman an eklere etikèt la, pran yon lekti nan ki strand yo te pran moute baz patikilye ki make. Se etikèt la Lè sa a, klavye, ak sik nan pwochen kòmanse ak yon baz nouvo. Apre selil koule a te trete avèk chak baz (4 sik), kwadon an fin ranpli, ak yon nouvo moun kòmanse ankò avèk baz nukleotid inisyal la.
Kounye a, HeliScope TM la ka li fragman ADN sou pè 55 baz nan longè. Baz yo pi plis nan sekans lan, pi ba pousantaj la nan strings ki ka itilize nan yon echantiyon, paske gen kèk seksyon sispann elaji pandan pwosesis la.
Pou li nan 20 oswa konsa baz, sou 86% nan strings yo ka itilize. Pou pi long li (55 + pè baz) pousantaj sa a gout apeprè 50%.
Single-molekil Advantage la
Pandan ke plizyè lòt konpayi yo ofri divès kalite sekans-pa-sentèz teknoloji ak platfòm debaz segondè, divès kalite reyaktif diferan, nan depans konparab, ak pou kout li nan 25-40 baz pè, sèlman Helicos li sekans ADN nan yon sèl nucleotide nan yon moman ak patante yo etikèt teknik ki sansib ase yo ki pèmèt li sou yon molekil sèl. Lòt metòd mande pou ADN anplifye (lè l sèvi avèk PCR ) pou fè plizyè (milyon) kopi anvan sekans. Li entwodui potansyèl la pou yon degre siyifikatif nan enfidelite akòz pwosesis erè pa anzim polymerase pandan anplifikasyon.
Kòm nan mwa avril 2008, HeliScopeTM la te rapòte ka sekans dè milya de baz nukleotid pou chak jou.
Helicos se yon manm nan Kowalisyon Medsin pèsonalize e li te resevwa finansman sibvansyon $ 1000 $ . Genomom $ 1000 la nan yon sèl jou se yon objektif projetée ki ta ka mande sekansè a pou li travay dè milya de baz pa èdtan. Kounye a, sekansè a pwototip ta pran ane yo idantifye yon genomic tout antye, ki ta koute pi plis pase $ 1000.
Aplikasyon pou teknoloji tSMSTM yo anpil, ki gen ladan deteksyon varyant jenetik nan imen ak lòt espès pou detèmine kòz maladi, rezistans antibyotik nan bakteri, virilite nan viris ak plis ankò. Kapasite nan detekte yon jèn sèl san anplifikasyon gen anpil itilizasyon potansyèl nan anviwònman mikrobyoloji, tankou teknik jenetik yo souvan itilize yo detekte solid, ki pa kiltrab mikwo-òganis oswa sa yo ki te jwenn nan tè ak lòt matris ki entèdi izolasyon pa metòd aktyèl. Anplis de sa, nati a nan echantiyon anviwonman souvan prezante difikilte pou anplifikasyon jèn lè l sèvi avèk PCR, akòz pwoblèm kontaminasyon. Sepandan, difikilte sa yo ta dwe simonte tou nan lòd pou polymère anzymes yo itilize nan tSMSTM pou fonksyon san entèferans.
Teyori a dèyè sekans sèl-molekil se jistis debaz, epi ou ta ka mande poukisa pa gen yon sèl te panse de li anvan. Malgre ke li senp ase, gen anpil konpozan teknik ki enplike nan devlope tribin sa yo, ak anpil defi pou kenbe Helicos okipe, ki gen ladan devlopman nan reyaksyon chimik ak nouvo reyaktif, asyèt ak lektè debi segondè. Kapasite nan detekte fluoresans nan yon etikèt sèl sou yon baz yon sèl egzije pou trè sansib instrumentation , ak chimi pou etikèt ak detekte siyal bezwen yo dwe jis dwa pou misyon pou minimize entèferans ak optimize fidelite nan polymerase AD a jan li aplike nan modèl imobil ak etikèt Nukleotid. Sa yo se kèk nan defi yo te fè fas a pa Helicos kòm li kontinye devlope teknoloji sa a nan espwa ke yon jou yon sèl bay $ 1000, 1-jou jenòm imen an.